《澳门风云3》的故事延续上集刘嘉玲跳飞机"自杀"后，对她痴情一片的张学友发誓要为她报仇，于是布局追杀周润发。在电影中，刘德华、张家辉、李宇春将组成铁三角，李宇春还将有突破性的打戏。

阿king（刘德华 饰）当年因出千被捕，事实上他是被人陷害的。出狱时他为他接风的是崇拜他已久的化骨龙（张家辉 饰），化骨龙是个终日无所事事的人，希望能跟着king有所作为。出狱后的king到处寻找已怀孕的妻子（张慧仪 饰），与当日的得力助手（张锦程 饰）， 后来King与化骨龙妹妹晴（朱茵 饰）产生了好感。 King得到Rocky（吴志雄 饰）的帮助上了赌船，碰见了多年前便想交手的马交文（高捷 饰），king想与之一决高低，却遭到马交文的手下省镜（李子雄 饰）陷害，揭开了king的底细更想进一步迫害king，king又能否躲过劫数呢？

身怀绝技、出手不凡的陈子龙是潜伏黑道多年的卧底，作为老大长毛雄的左膀右臂，他的身心承受巨大压力，加上老大已对他升起疑心，威胁子龙妈妈的性命，他急切希望复职，退出黑道。这一次，雄哥派子龙前往内地查探组织成员Sunny罗志伟的虚实。Sunny出身美国唐人街，早年曾跟子龙混迹江湖，但逐渐做大的他暗中黑了雄哥的货。另一方面，子龙的上司张警官以复职为交换，同样命子龙调查Sunny。谁知内地之行凶险非常，Sunny为人狡猾毒辣，而与内地警方的配合又矛盾冲突频频，加上神秘刺客“刀锋”时隐时现，子龙不知不觉踏入阴谋重重的漩涡之中……

梁宽(张家辉饰）乃一低级警务人员，多次担任卧底小角色。郁郁不得志之时，长官忽派他调查大老千法拉利（王晶饰），宽遂找到自信。一日宽陪女友pizza（关秀媚饰）参加姐姐（吴君如饰）为姐夫大老千黄师虎（周星驰饰）短暂出狱期间举办的宴会。宽在宴会上态度嚣张，终被黄师虎整蛊，于是怀恨在心。 宽卧底于法拉利周围，在沙滩上偶遇美女初恋（林熙蕾饰），被其美色所迷。宽自认得到法拉利信任，不料，还没找到犯罪证据，反而先落入初恋的美人计陷阱中，差点丢了工作。Pizza不计前嫌，与宽商量找姐夫帮忙，却不料姐夫早已为宽设下了无数难题......

天下会帮主雄霸欲得天下，请神算泥菩萨批算，泥菩萨预言他的前半生：“金鳞岂是池中物，一遇风云便化龙。”于是雄霸下令找两名孩童收为徒弟，他们生辰八字要与批示相符，以助雄霸大业。他们就是聂风和步惊云，但实际上二人都与雄霸有不共戴天之仇。风、云与大师兄秦霜及雄霸女儿孔慈成长成人，习得一身好武艺，天下会几乎称霸武林。惟有死对头剑圣让雄霸不放心，但“成也风云，败也风云”，雄霸开始以女人为工具对付聂风和步惊云，并造成孔慈之死。逃走的步惊云为楚楚所救回。步惊云、聂风携手对付雄霸……

高进在同师父千王靳能学过将近10年技艺后，熟练掌控一切千门技巧，加上与靳能的女儿靳轻情投意合，17岁的他可谓春风得意，为了与靳轻风风光光的成婚，他答应靳轻将事业推向高峰，决定参加在澳门举行的新一届“赌神大赛”。令他没想到的是自己会马失前蹄。高进大赛中被靳能出卖，虽因爱慕他的细七与好友龙五伸手相助得以侥幸保命，却也几乎成为废人。在细七的精心照料下，高进奇迹般痊愈，晓得了事情的真相，同时发现多年前父亲死的真正原因，新仇加旧恨促使他振作，决意与师兄高傲及靳能在赌桌上再战生死，取回属于自己的东西。

7岁女孩张望和父亲张国华相依为命，生活虽是清贫，但还是生活的很幸福。一天张望突然流鼻血不止，去医院检查，才知得了急性白血病，治疗需要30多万的费用，筹钱无果的张国华整日以泪洗面；而张望，清楚自己的家庭情况，毅然决定放弃治疗。记者王小月得知此事，赶往张国华家中，才得知了张望的真实身世。事件经媒体曝光后，张望引起社会各界关注，全国各地纷纷捐款资助，很快，张望的医疗费就凑够了。感受到社会爱的力量和无数陌生人的关心，也使张望变得无比坚强，她用常人难以想象的痛苦接受着治疗，并一次一次经历着鬼门关，然而就在大家都认为张望的病快要好起来的时候，张望却做了一个出乎所有人意料的决定……

中五在读的朱婉芳（袁洁莹 饰）与郭小珍（李丽蕊 饰）本是一对儿普通的中学女生，直至帮派分子刀疤试图接近朱婉芳，在校门口殴打一名不良学生致其意外身亡。警官海哥（林正英 饰）要求朱婉芳出面作证，虽然刀疤之大哥潇洒（张耀扬 饰）恶语威胁，但朱婉芳有感温老师（刘松仁 饰）与海哥的正气，终于指认嫌凶。潇洒大为光火将朱婉芳掳走勒索，温老师在众目睽睽之下却无力保护自己的学生。为偿还欠款，朱婉芳与郭小珍打工度日，刀疤从旁默默相助终于令婉芳留意他温柔的一面。不久郭小珍发现男友佐治背叛，伤心欲绝之际遭车祸身亡，朱婉芳的世界，突然间分崩离析…… 本片是林岭东风云三部曲的最后一部，剧本仍由其兄林岭南（南燕）操刀。

警察在一次抢劫案中枪导致半身不遂，同案中负责为歹徒开车的流氓则中枪变成植物人。在智慧老人夺舍变身后的吴倩莲指导下，警察利用混混的躯体重生。 混混在他家乡大屿山恶名远播，但新的混混却聪明机灵而有正义感。

一个自小在公共屋村长大的小伙子飞全（张智霖），胆色过人，智勇双全，他下决心要在黑道闯出自己的天下。凭着自己的实力，他很快就“出位”，金榜提名，成为黑社会十大杰出人物之一，他的行动也渐渐引起了反黑组警员李SIR（李修贤）的注意，他试图挽救还没有陷得太深的飞全，但声势正如日中天的飞全对李SIR的忠告却置若罔闻，认为靠自己便什么都可以解决，可是这种想法终于要了他的性命……

黑帮14K首脑尹志巨，多年来一路打拼，从最初的帮会小弟到呼风唤雨的大哥，风光背后却又危机重重。他和一众兄弟好友结成七小福，凭借年轻果敢和好勇斗狠在群龙盘踞的弹丸澳门占有一席之地。但江湖一旦涉入，便难再脱身。逐渐爬上顶峰的崩牙巨与另一个强大势力摩罗炳展开连番恶斗，澳门一时间刀光剑影、血雨腥风。两虎相争，必有一伤，澳门江湖第一把交椅引得两派人马血流成河……

杀手杀人总有个价钱，从最低的几万元起至几千万，但最近出现了一个奇怪的杀手，他不收酬金，但杀的都是该杀的权贵，传闻他自称为“炽天使”。 当年侵略中国的一名日本人在香港被“炽天使”杀害。杀手为了得到酬金找出了“炽天使”，原来“炽天使”是一名香港专杀坏人的警察指挥官。 小富后来与“炽天使”一同杀死了想杀“炽天使”独得酬金的日本暴徒，成为第二代“炽天使”。

20世纪50年代末60年代初的香港乌烟瘴气。其中，九龙城寨更是一个龙蛇盘踞，令人闻风丧胆的混乱所在。无所事事的小青年阿豪和阿乐偶然混迹于此，为这里的乱世气氛所感染，乐不思蜀。他们合伙赌马诈钱，惹来庄家追杀，幸得当时城寨大哥肥宝出手方保住性命，二人的命运也自此发生转变。 阿豪拜入肥宝门下，后与肥宝的小姨子大胆英相恋，他果敢勇猛，风头无两；阿乐当上警察，与曾和阿豪有染的女孩菲菲结婚。为了让虚荣的妻子过上幸福生活，他不惜选择贪污堕落。两个分处黑白道的好兄弟，携手打拼出一个属于他们自己的天下……

钟少雄导演的此片意在强调香港电影事业的衰败惨景，并不恐怖，但其在有限的条件下，拍出这部困兽式悲情片，表现了电影人如入地狱的噩梦处境。然而该片过火失控，比起前些年的《阴阳路》系列中用鬼戏院讽刺电影业困境的黑色幽默感，有不及之感。剧情讲述了即将来临的一九九九年最后一夜，北角英皇道一间旧戏院面临封铺关门，放映员扬扬（雷宇扬 饰）正放映最后一场电影，观众只有其女友姚姚（姚乐怡 饰）一人，却不料发生了闹鬼事件。

痞子武松前往阳谷县寻找家兄武大，到景阳冈上骗吃骗喝，却借着酒意误打死一只老虎。阳谷县人将武松簇拥回县，县太爷将他封为都头。另一边，潘金莲与武大两夫妻正商量着如何骗钱，将目标锁定有钱却白痴的西门大官人。他们二人找到王婆，开始设计一个精细的行骗计划，而此时武松上门寻找家兄，二人害怕武松搅乱计划，所以百般隐瞒……

三名青年去露营，遇到三名陌生女子便一起大讲鬼故事，Kent自认大胆，提议到附近坟场炒墓碑上死人的资料，在抄墓碑时发现了其中一名刚认识女子的墓碑。

17岁的Coco自丧母后性情变得孤僻，又不能与疏离已久的离异父亲相处，身为反黑组沙展的刀片叔忽略沟通之道，只适以严厉管束，使Coco更为反叛，流连夜店，沉沦毒海。她认识了一位在黑社会罕有的正义人物阿箭，可惜世上所有人都想拆散他们。他们想回头却被新扎大佬追杀，阿箭被杀，Coco惨遭轮奸。刀片懂得关怀爱女已太迟，唯有以鲜血教导她回归正路……

曹警司为了使过气黑帮头子戴哥大做警方污点证人，指证黑帮头子巫二器的罪行，设计逼犀牛皮、大生地、花塔饼、罗汉果等四位有福星之称的私家侦探做卧底，曹又派他的女儿高级帮办Banana应征做女佣人暗中保护他们。四福星入狱救出戴哥大，同往找他的女儿Mina，适值巫二器正欲迷奸她，他们把她救出，戴哥大感激四福星，答应做污点证人指证巫二器的罪恶，但给巫二器想尽一切办法开脱了罪名。曹警司又安排Banana诈被巫杀死，激发起四福星替她报仇的斗志。片末，四福星和警方一起逮捕了巫二器，把他领导的匪帮全部消灭。

六十年代的香港警界贪污成风，导致黑狱重重，《正报》记者程安撰文揭露警界黑幕，被探长张耀祖视为眼中钉。张耀祖陷害程安藏毒，使其入狱，更将程的女友小慈玷污。 程安在狱中作为帮派人士之外的“羊”，虽有“羊”看顾，也受尽大佬们侮辱。程安凭借正气与知识为犯人声张权利，逐渐获得大佬们器重，狱中生活有所好转。 不久看守“无人性”将犯人“三只脚”害死，程安借报界朋友使三只脚冤仇得雪。小慈依靠另一探长势力将张耀祖下狱，沦为犯人的张耀祖计划在狱中报复程安，两人的对决在所难免。

东升社在老大骆驼的重整下声势日盛，而洪兴社在蒋天生（任达华　饰）的管理下亦蒸蒸日上。两个帮派暗中有不少争斗，但表面上两个帮派仍和和气气。东升社的乌鸦（张耀杨　饰）野心极大。他在东升社的最大势力所在地荷兰阿姆斯特丹市枪杀蒋天生，再嫁祸于陈浩南（郑伊健　饰）。洪兴社的众人都以为陈浩南勾结外人杀死了蒋天生，派出大飞追杀陈浩南，陈浩南侥幸逃脱。乌鸦见骆驼病重，乘机将其杀害，顺利坐上了东升社老大的位置。乌鸦准备为骆驼举办一场风光大葬。葬礼当日，各路江湖人马齐聚灵场，浩南、山鸡（陈小春　饰）亦出现了…

一队摄制队走去海湾进行拍摄，得到当地村长雄叔（吴志雄饰）的款待，导演祥（黎耀祥饰）选择海边石池作背景，拍摄歌星敏（李惠敏饰）之MTV，及后听到村内不时传出鬼叫声，所有工作人员也吓得目瞪口呆。当中更要雷探长（雷宇扬饰）出面调停他们与村民之纠纷，因为村民不满他们的装束破坏风水。拍摄还是要继续下去，邪童的出现令事情的真相水落石出，内里隐藏著一段发生於二十年前城市青年古（古天乐饰）与村女盈（陈松玲饰）之间的动人爱情故事。

高级警官华岂伦（陈小春饰）奉命调查此案，他出人意料地选了即将退休又胆小怕死的老警察介叔（柯受良饰）做他的搭档。其实介叔以前也很勇猛，他的两个干儿子晓泰（古天乐饰）和子年（谢天华饰）也是警察，当年三人同在旺角警署工作，号称“旺角三鹰”，但后来不知怎么子年殉职，晓泰坐牢，介叔也日渐消沉。

黑道大哥阿贵（黄秋生 饰）在母亲离世当日遇见茶餐厅老板娘阿媚（蔡卓妍 饰），阿媚递过来的一杯金桔蜜让阿贵甜在心头。阿贵陷入爱河，帮助阿媚打理其父亲遗留的一家茶餐厅，兄弟们也都早已当阿媚是他们的大嫂。却不料手下小弟阿良与阿媚早已认识，并互生爱慕。原本经营卡拉ok生意的阿贵想转做正行，其同样有黑帮背景的表兄弟Bill千方百计想得到阿贵的店铺却始终无法得手。他想从阿媚的茶餐厅下手，一个大阴谋正在酝酿……

电台DJ琛仔、乐少及长发三人主持鬼故节目，深受欢迎。不过，故妄言之，故妄听之，三人一向不信那些鬼故事。一晚，一名女听众来电，自言男友已死，她因此而非常心烦，三DJ本来好言相劝，但该女子愈讲愈心烦。长发不耐烦，教其一死了之。岂料，该女子后来真的自杀了，长发后悔不已。第二晚，该名女子又来电，长发惊心，只希望能帮她了却未完心愿，以示悔意。后来，该女子之母亲双目失明，便要长发读出她女儿的日记，长发既读，却发现原来该女带来新多情男友，竟然就要自己！最后，长发亦重覆该女的历程，跳楼身亡。好友逝世，琛仔为了开解柴少，便照原定计划，与老同学一起去游船河。岂料，在船上众人又遇上了一连串的怪事。结果，柴少亦相继丧命。琛仔兔死狐悲，怕自己会跟长发及柴少一样，不得善终，所以决心离职，另谋高就。究竟他最后又能否逃过大难？却视乎他今生前的造化。