一九四八年冬。三大战役激战正酣，国民党军败亡之势已不可阻挡。中国共产党成立以柴福东为首的特别行动队，秘密潜入南京，希望将地质学家蒋千里营救过来，用他绘制的长江水文图造福百姓，不料蒋千里已被保密局特务马伯驹软禁。柴马二人既是同窗，又是死敌；各自带领队伍短兵相接，殊死搏杀。中共特别行动队一次次挫败马伯驹的阴谋，历经千险终于完成任务，不但将蒋千里安全送去解放区，还把被国民党反动派盗取的宋皇陵稀世文物抢夺回来，归还人民。

该剧以大明王朝永乐年间为背景，讲述燕王朱棣通过靖难之役夺取皇位后，为巩固政权采取引蛇出洞策略清除异己，同时宦官集团趁机阴谋篡权引发朝堂动荡的故事。

明朝万历年间，魏忠贤虽出身贫寒，但又嗜赌成性，为了赌博典妻弃子，在赌场杀人逃亡，后净身投靠皇宫，巧遇旧时情人，已贵为皇太子奶妈的客印月，俩人狼狈为奸，一路发迹。但魏忠贤绝对想不到自己遗弃在糕团店内的儿子居然是颗福星，出生时被当作面粉娃娃上笼蒸煮竟大难不死，其后果然后福无边。傅应星生来人如“糕团”，面善心软，嫉恶如仇，但偏偏是个多事之人，误打误撞中竟三揭黄榜：一揭求雨、二揭为国家重臣治病、三揭去边关和满洲人谈判。

20世纪30年代的“十里洋场”上海滩，帮派林立，流氓称雄。职业杀手谭四在枪杀棉纱大王沈万林的过程中失手，仓皇而逃，最后幸得酒吧歌女王静秋所救，并结识静秋弟王静江。静秋爱上了谭四，但谭四却一直对自己的前妻梅雨念念不忘。暗杀沈万林的幕后黑手是其侄子沈豹，沈豹一直贪图沈万林的财产。李志雄是沈豹和谭四交易的中间人，更是谭四老友。

故事发生在某城市医院。秦火和孔天逸并列慈佑医院外科第一刀，各自擅长不同部位的手术。实习生顾岚久闻秦火大名，能分到他手下实习令她惊喜万分，但秦火铁腕式教学方法令顾岚不敢恭维。 因一宗病案秦火盲目确诊，顾岚提出相左意见，实习生诗婷指出顾岚的看法在医学上仅有万分之三的可能性，秦火非常满意诗婷在关键时刻站在自己一边。后来的结果令秦火大为惊异，他渐渐改变了对顾岚的看法。孔天逸非常赏识顾岚对待医学的严谨，俩人在工作中慢慢擦出了爱的火花。

江东机场，身穿国民党大校服装的我地下党工作者何娜，只身一人乘机前往香港接受我党在港地下组织工作安排，不想，飞机在飞行过程中遭到两架飞机的拦截而坠毁。何娜跳伞后历尽千辛万苦，终于踏上了香港的土地，接受了潜回大陆解放江南重镇江城的任务。江城火车站，一列火车刚要驶出车站，何娜击毙了车站国民党值日军官后，飞身上了军火列车驾驶室。在司机和司炉的配合下，使当地游击队盗取了军火列车上的大部分武器弹药，最后将剩余的军火和列车驶上了一座铁路大桥并实施了定时爆破。何娜和曹海等人发现了称为日本人的男青年其实是一个叫侯菊的中国女子，是号称“红鹦鹉”的江湖杀手，曾是日本黑社会组织“黑龙会”的成员。魏司令的女儿魏小姐出城游玩，被一伙强人绑架。何娜根据游击队员提供的情报，请宋弱水出面说情，将其救。魏司令对何娜非常感激。何娜与魏家的关系很好，从魏夫人的口中得知这位医学教授的进步思想，并影响到生性粗直的昔日抗日名将魏司令，我军将要解放江城，何娜制定了分化瓦解敌军的计划并得到我挺进纵队司令的认可。