故事叙述某市一个黑暗之夜，一辆高速行驶的摩托车穿街而过。突然一声枪响，惊破黑夜的寂静，被称为“黑道一哥”吕焕暴尸街头。刑警队长邹天明一直对数年前一桩未决的凶杀案耿耿于怀，他闻讯此出凶杀案后心里明白，他所等待的终于到来了……翌日，吕焕的弟弟吕东自外地匆匆返回。自此，血雨腥风弥漫了这个城市中每一个阳光照不到的角落……吕焕的妻子华红，一个谜一样的女人。警方和吕东都在极力探求她身上隐藏着的不可告人的秘密。而她却自蹈险境而浑然不觉。江湖疑云密布，一时杀机四伏。面对这一切，邹天明和他的队员们要在这场生死较量中，将这个城市的污垢荡涤干净，让阳光照遍每一个阴暗的角落。而他们所遇到的，却是前所未有的困难……

三十年代，上海。　　兰心茹是一家医院的外科医生，独自一人带着六岁的侄子生活，她的原则是只行医救人，不过问政治，但一次偶然的事件却阴差阳错地把她推向了风口浪尖，这个沉静内敛的女人将面临一次突如其来的生死抉择…… 　　齐玉珍是兰心茹的同事，也是我中共地下党员，她几次动员兰心茹加入共产党，兰心茹都笑着推辞了，但两人依然是无话不谈的好朋友。一天，前去传递情报的齐玉珍重伤归来，她用最后的力量告诉兰心茹，让她帮忙把一个情报传递出去，兰心茹答应了。　　兰心茹前去接头，却发现来接应的同志已经被捕。兰心茹通过对已知情况的推理，慢慢理出头绪：由于出现叛徒，我上海地下党组织遭到破坏，国民党上海警察局行动队队长陈占豪临走时，从我地下联络站里拿走了一尊佛像。而那尊佛像里藏着我上海地下党的全部名单，陈占豪一旦发现，我党将损失惨重！现在知情者全部牺牲，兰心茹不知道谁是共产党，为了救人，她做出了一个重大的决定：找到佛像、拿出情报、交给共产党！这个毫无特工经验的女医生开始去完成一个不可能的任务…… 　　与此同时，我武汉党组织派出特工黄维君，来上海寻找那份失踪的名单。　　兰心茹把孩子送到乡下，换了一家医院，开始观察陈占豪的行踪，她发现陈占豪的地下情人居然是她的中学同学向秀娟，向秀娟为了给弟弟治病而委身于陈占豪。当两个女人冰释前嫌之后，向秀娟开始帮助兰心茹。　　叛徒刘天舒是个首鼠两端的人，他只想拿到赏金远走高飞，他发现他的女友兰心茹行踪可疑并开始跟踪。　　兰心茹一边寻找机会，一边以一个医生的天职治病救人，青红帮身中数刀的老大、命悬一线的女病人、赖在医院不走的老太太……而这些人，都在她以后的逃亡生涯中给予了极大的帮助。　　黄维君了找到了线索，他以粉刷大楼为借口准备盗取佛像，就在他动手之际，兰心茹先行一步，在众人的帮助下，兰心茹以某种刺鼻无毒的气体制造恐慌，扮成毒气专家进入警察局大楼，以调包的方式，将佛像装入了运往剿共前线的军火专列，然后去江西提货，陈占豪经过一夜的冥思苦想，识破了兰心茹的计谋，他飞往江西，前去拦截…… 　　兰心茹拿到情报，但她只能返回上海，因为她知道共产党在上海找她，陈占豪也断定回上海是兰心茹唯一的选择，他在上海的交通要道布下重兵，并将兰心茹的亲朋好友全部监控，等待兰心茹的到来。　　兰心茹远没有陈占豪想的聪明，她的无知和单纯反而帮她逃过一劫，但巧合不会再次发生，面对警察局警察的围追堵截，毫无经验的兰心茹顷刻间陷入绝境，她不会用枪，不会伪装，她先后藏于女病人家、妓院，教堂等地，在恐惧中度日如年，她甚至想到退缩，打算离开上海，但共产党扰乱敌人的枪声又给她传达一个明确的信息：共产党每时每刻都在找她！为了当初的诺言，为了救人，她又咬着牙留了下来。　　共产党确实在寻找她，黄维君为了干扰搜捕，甚至冒着生命危险袭击陈占豪，叛徒刘天舒也加入搜查的行列，陈占豪的警察搜遍了旅馆、舞厅、电影院、大烟馆……各方都在寻找，但兰心茹人间蒸发，此时的兰心茹已经扮成病人进入传染病房，这里暂时是最安全的地方。　　一个偶然的机会，陈占豪得知自己的地下情人向秀娟和兰心茹有秘密来往，他心中一动：向秀娟会不会向兰心茹提供情报？能不能利用向秀娟？而此时，兰心茹也以医生的冷静睿智梳理着自己的思路：现在最急切找到共产党的有两个人，一是自己，一是陈占豪，能不能从陈占豪那里得到共产党的信息？　　陈占豪将计就计，以刘天舒为诱饵捉拿兰心茹，关键时刻，向秀娟以血肉之躯换来了兰心茹的平安，刘天舒叛徒的身份暴露，他层层走访，绑架了兰心茹的侄子，为了孩子安全，黄维君尾随其后，追杀刘天舒。　　刘天舒向兰心茹发出暗号，要求兰心茹以情报换回孩子，兰心茹向黄维君发出暗号，希望得到帮助，黄维君在和陈占豪周旋，……一场大对决在江边展开，短兵相接的枪战以后，刘天舒中枪后，再次逃脱。兰心茹拿出情报，跟着黄维君踏上了奔赴苏区的征程…… 　　兰心茹拒绝了黄维君为她安排一份安稳工作的建议，她把侄子安排给黄维君，不辞而别，同时消失的还有自己那把手枪。这个文静的女医生又有什么打算呢？很快，黄维君就有了答案，他们坐上火车，向上海追去。

本剧是一部描写现代家庭情感的电视剧，导演和主创人员皆为电视剧《红蜘蛛》的原班人马。每两集一个故事，通过对十个具有典型性的“问题家庭”的案例分析，向人们提出警示—该以怎样的态度面对家庭矛盾，以维持家庭的圆满，避免悲剧的发生，促进社会的安定团结。剧中通过十个家庭案件，揭示出个人内心的虚弱，描绘了人们由于情感错位引起的犯罪。导演将通过“情感十戒”向观众警示：每个人都应保持对生存的警戒，坚守生存规范。　 该剧延续了《红蜘蛛》的纪实风格，并且加强了整体的艺术性。都晓介绍说，《家庭档案》不完全是纪实，但故事却力求真实，贴近老百姓的生活。为此，在演员的选择上剧组拒绝大腕加盟，选用一些实力很强的演员，除

牛、赵两家是互相帮衬的好邻居，日子虽不富裕但也其乐融融。知识青年上山下乡的风潮席卷城镇，牛淑荣和赵欣梅向家人表示了要上山下乡的决心。在黑山屯，她们共同爱上了英俊的知青模范齐伟。在各种劳动竞赛里，三人的感情关系此消彼长，不断受到外界的催化，牛淑荣和赵欣梅也因此互生芥蒂。最终，牛淑荣与齐伟成婚，赵欣梅却嫁给了牛淑荣的哥哥牛成国。进厂以后，面对百废待兴的局面，牛淑荣和赵欣梅共同努力，使得工厂扭亏为盈，她们也因此成为女工心目中的英雄，不过感情上的矛盾却一直没有化解，一直到齐伟因意外逝世，牛淑荣和赵欣梅的子女齐胜男和牛争彼此相爱，两个女人才悟出了生活的真谛，读解到了和谐中的幸福指数，她们共同为牛争和齐胜男的儿子取了一个响亮的名字：牛和平。