故事将来到新加坡，讲述寻找19世纪末随着沉船沉入海底的蓝宝石“绀青之拳”的故事。故事中，柯南和怪盗基德被卷入滨海湾金沙酒店的杀人事件中，一场来自新加坡的巨大阴谋将他们裹挟……

在北海道函馆的一场剑道大会上，名侦探柯南与西部名侦探服部平次再次卷入一场悬案。本案牵涉到怪盗基德意欲盗取的江户时代新选组副长土方岁三的日本刀，此刀不仅是传奇藏品，还与寻找能扭转幕末纷争秘宝的美籍日裔军火商有着不解之缘。随着案情的逐步深入，一连串的谜题和危机接踵而至，柯南和平次必须揭开真相，解决危机。

怪盗基德的预告信，出现在了北海道函馆斧江财阀的收藏库中。这次基德将要盗走的是江戸幕府时期新选组副长土方岁三的日本刀。向来追逐奢华宝石的怪盗基德，居然会看上刀？此时，被称作西部名侦探的服部平次和柯南一行人，也因为剑道大会来到了函馆，在基德执行预告的当日，平次看穿了基德的伪装并对其穷追不舍！

故事发生于东京，在全球最大体育盛事WSG即将召开之际，知名企业的高官却接连在赞助商酒会现场遭到绑架，而自新名古屋站至东京的最高时速1000km的真空超导磁悬浮列车也被卷入其中，一场牵动国际目光的重大案件就此展开。

在纽约拍卖会现场，全世界的大富豪汇集一堂，竞拍国际名画这便是，原本应该在日本被烧毁的梵高名画「向日葵」铃木次郎吉以远高于他人的价格3亿美金 将此画拍下他的目的是集齐散落在世界各地的7幅「向日葵」以此能在日本举办史无前例的大规模展会。这则梦幻大新闻向全世界播出的同时，柯南与小兰也津津有味的看着转播当正要征集专门保护「向日葵」的7人护卫队七大武士的时候怪盗基德突然出现，撂下了「一定会将此画夺走」的宣战预告明明只偷大型宝石的基德为什么会对名画下手？就在此时，在一片骚动的会场上出现了追随基德而来的高中生侦探工藤新一的身影！不久之后，在载有「向日葵」的客机飞往日本的途中在空中遭受到了白色身影的突然袭击围绕独一无二的珍宝，谎言与真实交织的艺术推理剧拉开序幕

据日本媒体报道，人气动漫《名侦探柯南》的全新特别篇作品《名侦探柯南：章节ONE 变小的名侦探》预计将于今年冬季播放。据悉，该剧由漫画原作者青山刚昌全面把关，对1996年1月8日播出的TV版第一话“云霄飞车杀人事件”未详尽描述的细节部分，例如各个角色的举动以及内心活动等进行了进一步的展开，并埋下了关系到之后800多话剧情的伏笔，是一篇全新的“起始章节”。《名侦探柯南》是一部讲述小学生侦探柯南解决众多疑难案件的人气漫画，1994年开始连载于《周刊少年Sunday》（小学馆发行）。TV版动画于1996年开始播放，次年开始制作剧场版动画。在TV版动画第一话“云霄飞车杀人事件”中，高中生侦探工藤新一和青梅竹马的女友毛利兰在多罗碧加乐园约会时遇到了杀人事件。身为侦探的新一揭穿了这场杀人事件的骗局，不料却在目睹了行动诡异的黑衣男子的交易场景之后，遭到背后袭击并被灌下神秘组织新研发的毒药Apoptoxin 4869，醒来时身体便回到了孩童状态。据介绍，本次的全新作品《章节ONE》是纪念TV版动画播放20周年的2小时特别篇。